75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00200 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  100 
 
 		 326 aa  600  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.09 
 
 		 319 aa  290  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  52.67 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  46.57 
 
 		 347 aa  238  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  56.52 
 
 		 330 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.59 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  47.4 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  45.74 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.06 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  39.31 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.45 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  38.97 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  38.46 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  35.25 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  36.99 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.07 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  35.66 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.38 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.75 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.71 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.97 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  31.53 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  28.83 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  32.16 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  27.68 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  31.49 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  27.76 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  27.08 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  26.88 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  39.76 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.76 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.76 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.69 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.93 
 
 		 317 aa  49.7  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  26.87 
 
 		 273 aa  49.7  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.62 
 
 		 259 aa  49.3  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.15 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  32 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  43.04 
 
 		 169 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  34.12 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  20.86 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  28.24 
 
 		 319 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  36.84 
 
 		 318 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  34.75 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  28.97 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  32.09 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0168  hypothetical protein  27.35 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0401  hypothetical protein  28.26 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  28.9 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0465  hypothetical protein  28.25 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0969494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  27.74 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  27.78 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  26.81 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39 
 
 		 302 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  25.86 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.71 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.6 
 
 		 303 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  26.28 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  29.23 
 
 		 297 aa  42.7  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  25.11 
 
 		 306 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 		 291 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  43.59 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>