162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27900 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  100 
 
 		 311 aa  571  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  53 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.67 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  33.77 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.43 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.06 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.43 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  36.64 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  33.05 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  34.3 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  34.68 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  30.7 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  39.07 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  26.13 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  34.88 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.99 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  26.78 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.17 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.1 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  32.28 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  25.25 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  28.47 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.02 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.95 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  35.38 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.42 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  30.09 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  24.25 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 		 530 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.33 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.37 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  28.78 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  28.78 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  29.77 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  23.38 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  22.95 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  28.42 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  29.31 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.39 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  23.02 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  30.95 
 
 		 330 aa  52.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  43.53 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.05 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.13 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  24.29 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 520 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  27.7 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  27.81 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  30.04 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  33.97 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.61 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  25 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.58 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  29.39 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  25 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  25 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  29.92 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  25 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  25 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.93 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  29.91 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.97 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.4 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  31.71 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  28.49 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  27.76 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  32.31 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.95 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.11 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  31.95 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  32.98 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  26.42 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  22.57 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.67 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  31.95 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  25.57 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25.84 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  24.22 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  31.85 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  27.4 
 
 		 284 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  27.4 
 
 		 284 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  23.89 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  30.82 
 
 		 359 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>