81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3470 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
313 aa  548  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  45.29 
 
 
290 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.31 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  45.66 
 
 
349 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  44.2 
 
 
299 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  34.02 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  31.6 
 
 
307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.46 
 
 
282 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.54 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  39.86 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  30.59 
 
 
347 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  29.93 
 
 
321 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  37.54 
 
 
299 aa  106  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.95 
 
 
381 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.15 
 
 
319 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  37.76 
 
 
330 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.06 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  37.06 
 
 
301 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  36.52 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.81 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.19 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  36.25 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.86 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  35.92 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  35.69 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  33.12 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  34.87 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  33.06 
 
 
297 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  32.64 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.98 
 
 
286 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.55 
 
 
317 aa  52.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  25.65 
 
 
296 aa  52.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 
307 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  27.76 
 
 
299 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.59 
 
 
298 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  30.04 
 
 
314 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  27.8 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  39.85 
 
 
169 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  21.74 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.72 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.49 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.15 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  29.59 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  28.42 
 
 
317 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 
309 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  24.87 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  30.05 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  40.28 
 
 
311 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  37.88 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  26.52 
 
 
320 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  28.24 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.78 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  35.8 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  29.1 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  45.07 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  29.97 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45965  predicted protein  35.44 
 
 
473 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  26.18 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  26.27 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  22.97 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.38 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 
311 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.63 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  27.1 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  27.1 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.35 
 
 
289 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  33.14 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.22 
 
 
161 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  27.66 
 
 
320 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  27.1 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  38.71 
 
 
308 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3044  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
285 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  43.94 
 
 
316 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0110  hypothetical protein  24.73 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.56 
 
 
315 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 
317 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  24.41 
 
 
319 aa  42.4  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>