More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3308 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  100 
 
 		 307 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  98.05 
 
 		 307 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  69.54 
 
 		 169 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  42.46 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.35 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  43.35 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  40.64 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  42.75 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.91 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.55 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  39.23 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  38.1 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.58 
 
 		 313 aa  99  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  29.85 
 
 		 347 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.49 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  31.4 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  34.42 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  38.57 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  29.35 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  28.99 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  33.9 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.5 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  31.58 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  28.26 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  29.33 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.55 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  33.65 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.08 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2994  hypothetical protein  31.06 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263501  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  31.5 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.65 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  30.38 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  33.21 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  29.9 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  30 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  28.87 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  25.09 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  32.86 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  31.06 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.27 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  27.04 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  31.82 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  31.82 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  31.82 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  31.82 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  31.82 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  31.82 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  31.82 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.41 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  25.34 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  34.08 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  30.03 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.49 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.51 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  27.89 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  24 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  25.46 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  31.23 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  30.96 
 
 		 379 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  34.96 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  29.49 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  30.55 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  30.93 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  24.49 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.62 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.5 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  30.27 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  24.74 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  25.7 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  32.5 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  33.06 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  25.67 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  26.07 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  25.23 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.86 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  29.93 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  32.92 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.62 
 
 		 282 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  27.95 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  29.78 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  23.41 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>