69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2269 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 293 aa  532  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  38.59 
 
 		 347 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.77 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  44.62 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.96 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  46.54 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  40.56 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.24 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  33.23 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.27 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.65 
 
 		 282 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  34.2 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.6 
 
 		 381 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  40.08 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  42.37 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  39.73 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  36.64 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  37.5 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.99 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  35.07 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.59 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  26.38 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  29.97 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.48 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  37.8 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  29.27 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  30.1 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  29.46 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  28.44 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.41 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  29.76 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.57 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3168  hypothetical protein  34.33 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  30.59 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  29.17 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  29.51 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.57 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  29.95 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  29.41 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  31.53 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  30.09 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  44.12 
 
 		 169 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.43 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  27.63 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.04 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  32.43 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  31.4 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  26.18 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  31.58 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  31.4 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  26.96 
 
 		 320 aa  42.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.14 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.98 
 
 		 397 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.95 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  29.28 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.81 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.09 
 
 		 280 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>