193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0305 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  640    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  70.81 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.22 
 
 		 317 aa  192  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.69 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.98 
 
 		 282 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.19 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  45.95 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  51.3 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  31.87 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  37.8 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  33.99 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.46 
 
 		 319 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.36 
 
 		 301 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  35.89 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  38.03 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  40.25 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.89 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  29.57 
 
 		 307 aa  94  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  39.32 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.3 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.5 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  34.74 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.17 
 
 		 297 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.17 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  36.44 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  33.43 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  32.64 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  29.34 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  33.66 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.14 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  34.74 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  34.91 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  34.78 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  35.51 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  34.91 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  29.96 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  30.05 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  33.49 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  30.05 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  30.05 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2840  hypothetical protein  32.35 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316251  normal  0.316711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  30.05 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  28.84 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  30.9 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  31.36 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4855  hypothetical protein  33.18 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  25.94 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  37.42 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  33.17 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  30.04 
 
 		 314 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  29.06 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.07 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.58 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  32.26 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  29.02 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.73 
 
 		 309 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.77 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 300 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  28.77 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  28.77 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  28.77 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  28.77 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  25.94 
 
 		 285 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  23.58 
 
 		 307 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  23.58 
 
 		 307 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.58 
 
 		 307 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  30.91 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.58 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.78 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  28.77 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  28.77 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.58 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  29.67 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.14 
 
 		 302 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  25.94 
 
 		 285 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  35.11 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.77 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.17 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.51 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.51 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5689  hypothetical protein  30.64 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0190255  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.51 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.17 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.42 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.51 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  33.13 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  24.78 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  28.7 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  27.14 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 		 520 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.53 
 
 		 310 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  29.09 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  29.55 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>