63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0475 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
381 aa  714    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  51.96 
 
 
311 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  50.53 
 
 
321 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  48.31 
 
 
347 aa  243  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  57.48 
 
 
330 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.97 
 
 
319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  57.61 
 
 
326 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  48.31 
 
 
307 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.95 
 
 
313 aa  127  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  35.58 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  39.48 
 
 
290 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  37.96 
 
 
299 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  36.36 
 
 
349 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.86 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  36.86 
 
 
301 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.43 
 
 
282 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.64 
 
 
317 aa  96.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.56 
 
 
293 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  34.62 
 
 
299 aa  90.1  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 
306 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  33.77 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.44 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.19 
 
 
308 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  39.64 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  27.69 
 
 
294 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  30.91 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
325 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  37.84 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 
318 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  37.14 
 
 
296 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  30 
 
 
297 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  29.7 
 
 
311 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  32.15 
 
 
294 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  37.42 
 
 
169 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.04 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  29.3 
 
 
293 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.46 
 
 
308 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.95 
 
 
289 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  24.36 
 
 
296 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  25.9 
 
 
288 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 
300 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.02 
 
 
317 aa  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
313 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.21 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.51 
 
 
284 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  29.13 
 
 
290 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  33.23 
 
 
316 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.83 
 
 
299 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  27.34 
 
 
273 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.88 
 
 
315 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  22.05 
 
 
324 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.86 
 
 
274 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  22.3 
 
 
296 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  25.51 
 
 
307 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 
317 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  28.77 
 
 
303 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.54 
 
 
306 aa  43.5  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.06 
 
 
287 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  28.85 
 
 
317 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>