112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2155 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  607  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  55.78 
 
 		 321 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  49.15 
 
 		 347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  46.49 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  45.58 
 
 		 330 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.64 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  45.96 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.15 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  30.86 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  32.53 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.59 
 
 		 282 aa  99  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  33.03 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  29.89 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.87 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  31.43 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.79 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  30.1 
 
 		 299 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.64 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  25.65 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.49 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  25.9 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  27.18 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  26.96 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  28.33 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  23.17 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  26.21 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  27.55 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  21.55 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.38 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.09 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  26.78 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  26.22 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  21.32 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 311 aa  52.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  28.22 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  21.96 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.33 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  25.16 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  26.15 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  31.02 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.42 
 
 		 300 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  24.25 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37570  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  29.57 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295733  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  28.9 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  25.93 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1171  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.93 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  24.91 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.19 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  29.36 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1225  hypothetical protein  26.37 
 
 		 274 aa  46.2  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000294223  normal  0.640031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  28.16 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  30.94 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  26 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  26 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  26 
 
 		 296 aa  45.8  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 		 312 aa  45.8  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  22.92 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  28.44 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  26.19 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  24.79 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  29.57 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.62 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.6 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  22.59 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.79 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.6 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.98 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.14 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.56 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  28.06 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  26 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  27.14 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  27.14 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  27.14 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  27.14 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  27.14 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.71 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  27.14 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.57 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.45 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  26.87 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.73 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  25.9 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0465  hypothetical protein  26.98 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0969494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  28.87 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.59 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.11 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  25 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.81 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>