93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2994 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2994  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  577  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263501  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.4 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.48 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  28.49 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  31.72 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.88 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  31.72 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.23 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.51 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  27.24 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.14 
 
 		 292 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  27.42 
 
 		 325 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 317 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  27.09 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  27.09 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  27.09 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  24.17 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  30.29 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.48 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.14 
 
 		 294 aa  49.7  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.12 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  23.57 
 
 		 317 aa  48.9  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  27.74 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  28.33 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  31.3 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.09 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.46 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  30.29 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  31.95 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  27.68 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  29.06 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  26 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  27.99 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  25.57 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  26.67 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  25.86 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  23.71 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  27.81 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.12 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.32 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  26.37 
 
 		 319 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  29.69 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.77 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.77 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  39.02 
 
 		 169 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.91 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.21 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  29.18 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.91 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.32 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  29.36 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.32 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1713  hypothetical protein  23.74 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  25.08 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.11 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.53 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.13 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  22.32 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  26.82 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  22.77 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  22.88 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.73 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.84 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  29.96 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  28.33 
 
 		 324 aa  42.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  24.03 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  27.69 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.32 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  23.4 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25.77 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  22.97 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  30.93 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.32 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>