More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1449 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
289 aa  545  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.25 
 
 
298 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.19 
 
 
298 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 
310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  36.81 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  33.1 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  33.57 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  32.86 
 
 
397 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  33.94 
 
 
305 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  32.18 
 
 
308 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  34.98 
 
 
402 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  28.11 
 
 
302 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  32.98 
 
 
328 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  32.54 
 
 
289 aa  99.4  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36 
 
 
332 aa  99  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  28.42 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  31.49 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  27.72 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.78 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 
311 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  29.41 
 
 
316 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  34.48 
 
 
353 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  29.01 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.94 
 
 
333 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  34.48 
 
 
356 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  34.48 
 
 
356 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  34.14 
 
 
356 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  34.14 
 
 
356 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  34.14 
 
 
356 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  34.14 
 
 
356 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.84 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 
292 aa  86.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  25.09 
 
 
296 aa  85.5  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  32.25 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  25.83 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  24.48 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  27.35 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  21.31 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  30.07 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  31.78 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  26.43 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  27.3 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.42 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  27.4 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  26.45 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  27.92 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.79 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  27.55 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.25 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  27.92 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  30.91 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  30.42 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  29.06 
 
 
532 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  25.93 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  31.14 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  24.13 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  27.11 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.6 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  26.6 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  31.03 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  30.68 
 
 
319 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0333  hypothetical protein  28.57 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.950508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  27.67 
 
 
341 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  24.74 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.39 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.11 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.61 
 
 
317 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  28.08 
 
 
300 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  29.89 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.51 
 
 
340 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  28.32 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  24.62 
 
 
327 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  27.34 
 
 
322 aa  62.4  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.6 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  25.52 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.05 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  25.38 
 
 
290 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.16 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  30.36 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  28.93 
 
 
365 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  27.84 
 
 
325 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  29.54 
 
 
314 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.05 
 
 
317 aa  59.7  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  28.48 
 
 
359 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.28 
 
 
307 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810804  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  28.48 
 
 
359 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 
319 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  26.15 
 
 
299 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>