260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4232 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
333 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.33 
 
 
298 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  39.72 
 
 
397 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  39.58 
 
 
309 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  39.58 
 
 
309 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  39.39 
 
 
312 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  40.64 
 
 
309 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  40.64 
 
 
309 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  40 
 
 
309 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  39.93 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.18 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.72 
 
 
332 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.49 
 
 
298 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  38.49 
 
 
308 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  30.1 
 
 
302 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  41.64 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 
310 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.05 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  38.44 
 
 
312 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  38.36 
 
 
356 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  38.36 
 
 
356 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  38.36 
 
 
356 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  38.36 
 
 
356 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  38.13 
 
 
353 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  38.62 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  38.62 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  31.82 
 
 
289 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  37.17 
 
 
302 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  34.17 
 
 
305 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 
289 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 
295 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  26.32 
 
 
303 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  25.61 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  26.96 
 
 
304 aa  86.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  31.02 
 
 
316 aa  85.9  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  27.76 
 
 
281 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  26.04 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.56 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  23.76 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  25.61 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  29.97 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  23.47 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  22.14 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  28.72 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  29.76 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  22.73 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  22.38 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  26.64 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  29.39 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.28 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  26.01 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  27.74 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4861  hypothetical protein  26.33 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5181  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.12 
 
 
300 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  25.61 
 
 
532 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  34.27 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  23.05 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1713  hypothetical protein  25.08 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165922  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  24 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  23 
 
 
304 aa  63.2  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  28.74 
 
 
351 aa  62.4  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  28.87 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  25.68 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  22.92 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.16 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  25.34 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.53 
 
 
305 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  26.35 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.28 
 
 
308 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  26.15 
 
 
325 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4902  hypothetical protein  27.2 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4746  drug/metabolite transporter family membrane protein  27.2 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4765  drug/metabolite transporter family membrane protein  27.2 
 
 
300 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  26.91 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  23.15 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5277  hypothetical protein  27.2 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0069  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25 
 
 
300 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5146  hypothetical protein  27.2 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  25.34 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5190  hypothetical protein  27.2 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  22.92 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1545  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.42 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0256706  decreased coverage  0.0067742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  26.64 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  25.68 
 
 
313 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  27.91 
 
 
312 aa  57  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.53 
 
 
319 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000893438  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
278 aa  55.8  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5175  hypothetical protein  26.82 
 
 
300 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  29.71 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0201  hypothetical protein  24.47 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.930951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>