194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3054 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  100 
 
 		 302 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  70.28 
 
 		 309 aa  374  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  68.04 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  67.48 
 
 		 325 aa  362  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  66.32 
 
 		 322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  65.77 
 
 		 323 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.92 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  64.57 
 
 		 306 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.25 
 
 		 305 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  53.85 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.86 
 
 		 305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  50.49 
 
 		 532 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  51.53 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  47.92 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.02 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.34 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  44.6 
 
 		 304 aa  195  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  45.26 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  41.64 
 
 		 281 aa  182  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  43.31 
 
 		 319 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  34.54 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.02 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  35.03 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  35.27 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  33.45 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  31.42 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  29.25 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  28.08 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  28.35 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.97 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.74 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  27.59 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.75 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  28.98 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  27.05 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.55 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  29.72 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25.19 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  29.27 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.37 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  23.37 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  31.36 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  28.98 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  28.98 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  27.99 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  28.37 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  24.44 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  23.65 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.4 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  21.29 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  27.38 
 
 		 334 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  21.4 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  31.86 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  20.91 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  26.86 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  23.65 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  27.75 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.41 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.86 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  22.76 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  28.01 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  28.01 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_002950  PG0333  hypothetical protein  28.12 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.950508 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  26.16 
 
 		 287 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.84 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  26.56 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  25.78 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.66 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  28.06 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  37.5 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1646  hypothetical protein  28.69 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  23.85 
 
 		 329 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  23.02 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  23.02 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.23 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  23.94 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  30.81 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  26.5 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  23.02 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  26.76 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  27.72 
 
 		 310 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.24 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  23.47 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  26.71 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  26.71 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  29.38 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  22.3 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>