230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0512 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0333  hypothetical protein  39.15 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.950508 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  29 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  29.33 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  29.06 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.05 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  28.98 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  30.31 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  30.26 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  27.97 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  27.97 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  27.39 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  29.21 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.68 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.78 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  29.76 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  28.33 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  25.89 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.99 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.91 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  29.35 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  28.57 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.66 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  28.87 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  28.87 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  28.89 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  28.77 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  27.71 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  28.67 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  30.8 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  29.55 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.5 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.81 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1646  hypothetical protein  26.64 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  28.07 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  26.37 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  26.37 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  26.37 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  26.37 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  26.37 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  26.37 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  26.37 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.88 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.09 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  25.28 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  24.42 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  28.04 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  27.17 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  26.54 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  22.11 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  28.14 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.47 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  26.71 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.47 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.21 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  27.43 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  30.77 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  26.87 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  27.43 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.89 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  22.79 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  26.87 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  23.16 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.11 
 
 		 305 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  26.58 
 
 		 299 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  27.62 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  21.74 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.86 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  25.77 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.89 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  23.16 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  24.89 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  25.19 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  24.91 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.02 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  22.99 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  26.86 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  29.9 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  26.05 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  26.15 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  23.53 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.26 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  29 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>