276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1436 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 331 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  41.23 
 
 		 324 aa  235  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  43.01 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  43.69 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  45.21 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  44.34 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  40.33 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  35.28 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  32.38 
 
 		 359 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  32.38 
 
 		 359 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  32.39 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  35.37 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.28 
 
 		 348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  32.88 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  32.35 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.66 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  33.59 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.63 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  35.25 
 
 		 356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.65 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.59 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.12 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  30.39 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.76 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  29.2 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  26 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.1 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  28.62 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  26.35 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  32 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.78 
 
 		 303 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  24.76 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  30.8 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  27.8 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  30.67 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  29.55 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.19 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.3 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  28.34 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  28.34 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  28.34 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  28.34 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  28.34 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  28.34 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  28.34 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.27 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.79 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  27.83 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  25.1 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  27.71 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  28.11 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  26.67 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  28.52 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  27.11 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  27.11 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.73 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  25.61 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25.23 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3478  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.42 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.89326 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  25.1 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  28.04 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  25.17 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  29.28 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  27.53 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  27.92 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  29.28 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.35 
 
 		 289 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  28.89 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.15 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  31.65 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.86 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  29.39 
 
 		 299 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  29.39 
 
 		 299 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 		 317 aa  52.8  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.31 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  27.39 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2238  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.68 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  27.3 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  20.75 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  21.28 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  29.01 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  25.1 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  27.3 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1605  threonine and homoserine efflux system  28.7 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140132  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  34.84 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  27.23 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.76 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  34.84 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.56 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1768  threonine and homoserine efflux system  28.7 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000270946  normal  0.0166943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>