139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3998 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 321 aa  610  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  49.68 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.52 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  41.53 
 
 		 320 aa  195  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.95 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.38 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  41.23 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  39.01 
 
 		 357 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  39.37 
 
 		 365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  40.8 
 
 		 342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  37.58 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  37.58 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  37.9 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  35.24 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  35.05 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.75 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.54 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.01 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  33.23 
 
 		 351 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  35.74 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  33.78 
 
 		 314 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  34.24 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.45 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  33.78 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  22.87 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  32.26 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  27.68 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  26.67 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  26.34 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.14 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.22 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  27.11 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  25.41 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  31.05 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  27.43 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  27.06 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  27.06 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  30.08 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  28.7 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  22.76 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  24.2 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  24.65 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.87 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  26.32 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  23.82 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.74 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  27.22 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  23.61 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.97 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  23.64 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  27.07 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  26.64 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  26.11 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.6 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  21.17 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  22.06 
 
 		 310 aa  53.1  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  26.03 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.51 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  29.8 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  22.65 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  22.65 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  24.23 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  22.58 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  22.65 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  25.11 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  20.79 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  26.37 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  21.43 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  26.97 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.38 
 
 		 317 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  25.11 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  23.02 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  25.11 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.12 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.02 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  24.76 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  26.09 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.54 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.38 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  27.16 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  25.53 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  25.11 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  26.38 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  23.48 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  24.32 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  26.58 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.74 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  27.93 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  27.93 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  27.93 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  27.93 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>