More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2037 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 335 aa  622  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  68.49 
 
 		 324 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  49.52 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  44.22 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.96 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  44.52 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  49.2 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  36.47 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  37.77 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  38.44 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  36.94 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  36.94 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  36.62 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  35.46 
 
 		 357 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.33 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.99 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.86 
 
 		 331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  36.05 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  35.99 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.65 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  34.39 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  38.49 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.45 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  35.16 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  34.43 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.43 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  34.43 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  34.43 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  34.43 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  34.43 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  34.43 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  34.43 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  28.89 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.46 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  34.33 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.71 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.58 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  29.08 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.07 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.59 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  33.09 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  25.77 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  30.25 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  32.54 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.49 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  30.82 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  32.6 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  32.6 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  32.6 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  32.6 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  30.07 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.7 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  26.51 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  28.47 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.28 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.9 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  28.33 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  21.43 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  29.58 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  31.16 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.66 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  31.85 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  21.43 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2981  DMT family permease  38.89 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190114  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.55 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.97 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  28.33 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  28.85 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  29.23 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  28.86 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1605  threonine and homoserine efflux system  32.09 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  27.3 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  29.92 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1846  hypothetical protein  32.31 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284209 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1768  threonine and homoserine efflux system  31.72 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000270946  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  27.74 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  31.45 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1500  threonine and homoserine efflux system  31.72 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.6519e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0928  threonine and homoserine efflux system  31.87 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  30.92 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  27.1 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8572  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.35 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  23.79 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  20.98 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  28 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  27.99 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  27.84 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2238  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.59 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  27.22 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  30.28 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.54 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  27.65 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>