91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2308 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
328 aa  614  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  37.8 
 
 
356 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  39.12 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  39.12 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.96 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.42 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.88 
 
 
348 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  39.38 
 
 
359 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  37.42 
 
 
342 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  36.77 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  38.54 
 
 
357 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  36.76 
 
 
320 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  41.37 
 
 
314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  37.01 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  37.42 
 
 
324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.22 
 
 
331 aa  123  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  32.98 
 
 
295 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 
331 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.29 
 
 
321 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  34.98 
 
 
314 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  33.54 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  33.77 
 
 
333 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.07 
 
 
335 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  28.71 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
520 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.67 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  31.37 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  23.03 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  22.96 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  31.54 
 
 
322 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  24.29 
 
 
322 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 
530 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  23.41 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  23.41 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  23.41 
 
 
322 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  23.41 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  26.32 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  22.95 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  23.53 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  24.01 
 
 
297 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  22.73 
 
 
322 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.04 
 
 
299 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  31.74 
 
 
296 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  23.98 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  24.56 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  23.27 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  22.19 
 
 
299 aa  49.3  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.95 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  22.5 
 
 
304 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  27.54 
 
 
312 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.95 
 
 
290 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.24 
 
 
308 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  29.53 
 
 
296 aa  47  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  24.85 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2930  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 
316 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  21.63 
 
 
303 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  20.61 
 
 
303 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.34 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  26.03 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.08 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  22.3 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  22.15 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  20.7 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  27.74 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  20.7 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  21.35 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  28.14 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  20.7 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  29.73 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  20.7 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  21.81 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  21.4 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  28.14 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  21.35 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  22.15 
 
 
304 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 
331 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  26.09 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  26.48 
 
 
317 aa  43.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  24.62 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  22.9 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  35.56 
 
 
379 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.38 
 
 
313 aa  42.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  25 
 
 
309 aa  42.4  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>