169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4964 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  703    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  79.17 
 
 		 342 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  68.77 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  68.77 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  69.34 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  46.55 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.73 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.27 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  39.18 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  38.02 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.28 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  39.62 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.77 
 
 		 328 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  42.51 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.37 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  34.69 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.14 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  39.04 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  34.64 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  35.6 
 
 		 314 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  36.99 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  31.15 
 
 		 351 aa  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  35.03 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.59 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.67 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  31.47 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  31.47 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  28.4 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  27.36 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  27.36 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  27.36 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  27.36 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  27.46 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  27.36 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  27.36 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  27.15 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3904  hypothetical protein  28.17 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  26.37 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  27.04 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.13 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.41 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  27.98 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  23.22 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.84 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  30.03 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.07 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.83 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  22.31 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  35.67 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  27.57 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  27.94 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  29.05 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 520 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  26.99 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  26.51 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  29.78 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  27.62 
 
 		 319 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.19 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.4 
 
 		 530 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  35.38 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  25.5 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  22.33 
 
 		 302 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 		 293 aa  53.5  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  26.42 
 
 		 293 aa  53.1  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 		 302 aa  52.8  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  26.19 
 
 		 295 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  30.96 
 
 		 306 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  26.19 
 
 		 295 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  25.95 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  26.78 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  26.78 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  27.76 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  30.04 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.12 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  25.88 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.14 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  21.79 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  30.06 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  26.69 
 
 		 288 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  26.49 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5965  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  27.73 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  21.79 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  21.79 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  21.79 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  28.91 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  21.62 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.83 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 		 326 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  21.96 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  21.79 
 
 		 322 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  21.37 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>