239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1625 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  609  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.31 
 
 		 335 aa  269  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  50.66 
 
 		 314 aa  231  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.23 
 
 		 331 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  44.56 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  48.59 
 
 		 322 aa  205  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  46.25 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  39.94 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  36.47 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  34.69 
 
 		 365 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.78 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  36.25 
 
 		 359 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  36.25 
 
 		 359 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  35.95 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  34.43 
 
 		 357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.58 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  38.6 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.43 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.55 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  34.81 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  36.33 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  36.09 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.59 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.87 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.15 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  36.52 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.62 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.12 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  26.46 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 520 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  33.81 
 
 		 358 aa  67  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  30.86 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.91 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  25.89 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  22.71 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.75 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.54 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  24.91 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.32 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.29 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  29.44 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  29.48 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  29.55 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  24.44 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  34.36 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.2 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24340  predicted permease, DMT superfamily  33.7 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.167703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  26.46 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2563  hypothetical protein  38.22 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  32.19 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2608  hypothetical protein  38.22 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2602  hypothetical protein  39.87 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.03 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  31.87 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.84 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  32 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  25.37 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  28.62 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  28.62 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.33 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  28.62 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  28.62 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  28.62 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  28.62 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  28.62 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  29.89 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.63 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  23.71 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  26.01 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  23.21 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 		 530 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  26.46 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25.97 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.73 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8572  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.84 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  21.77 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2238  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3392  hypothetical protein  34.44 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529802  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  26.01 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  29.1 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  21.77 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  31.1 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  25.57 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  24.64 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  31.1 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  31.63 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  27.15 
 
 		 532 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.24 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  27.85 
 
 		 291 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  24.23 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  31.03 
 
 		 319 aa  52.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2658  hypothetical protein  29.29 
 
 		 297 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2688  hypothetical protein  29.29 
 
 		 297 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>