More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0152 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  90.57 
 
 
297 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  89.9 
 
 
300 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  39.35 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  37.63 
 
 
308 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  36.93 
 
 
305 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.73 
 
 
302 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.76 
 
 
307 aa  169  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 
298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 
300 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.67 
 
 
295 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  32.63 
 
 
294 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  32.28 
 
 
294 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  32.63 
 
 
294 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  36.27 
 
 
310 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  35.79 
 
 
295 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  32.28 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  33.68 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  32.28 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  32.99 
 
 
295 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.79 
 
 
305 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.91 
 
 
302 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  31.94 
 
 
296 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  32.64 
 
 
295 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  38.13 
 
 
316 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  31.18 
 
 
286 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  33.11 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
284 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  36.33 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  29.76 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  30.1 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  30.1 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  30.1 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  30.45 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  30.1 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  29.76 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  30.1 
 
 
309 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  30.1 
 
 
303 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 
302 aa  125  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  30.1 
 
 
303 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  35.02 
 
 
288 aa  125  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.68 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.6 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  27.05 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.13 
 
 
295 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.13 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 
288 aa  117  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.71 
 
 
305 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  38.19 
 
 
318 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  38.98 
 
 
277 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  28.27 
 
 
296 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  30.51 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  32.43 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.72 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.2 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  32.67 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  29.19 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  29 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.32 
 
 
317 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.31 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  26.71 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  31.12 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.53 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  26.32 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  38.14 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  30.85 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  25.55 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  26.28 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  32.27 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.56 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  28.34 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  25.61 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.78 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.09 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  24.91 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.99 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  25.62 
 
 
281 aa  60.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  25.62 
 
 
281 aa  60.5  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  27.46 
 
 
311 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.55 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  25.56 
 
 
320 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  22.75 
 
 
325 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.6 
 
 
316 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.91 
 
 
304 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  24.65 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  25.37 
 
 
324 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  27.05 
 
 
317 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  25.29 
 
 
299 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.1 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  28.93 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>