More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5928 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 326 aa  625  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.62 
 
 		 319 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  49.66 
 
 		 301 aa  248  9e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  50.86 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  48.57 
 
 		 311 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.94 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.31 
 
 		 324 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.96 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  49.29 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.65 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.6 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3855  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00441298  normal  0.0499961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  34.46 
 
 		 310 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  33.21 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  32.89 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  32.35 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  31.27 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  29.26 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  33.45 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  30.28 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  32.31 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  30.07 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  29.39 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  28.67 
 
 		 302 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  29.93 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  29.93 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  29.05 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  29.93 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  27.3 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  30.17 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  28.87 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  30.14 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  30.1 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  30.1 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  29.61 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  31.14 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  30.71 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  30.23 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  30.51 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  30.63 
 
 		 324 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  32.03 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  25.67 
 
 		 300 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  30.11 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  30.99 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  28.77 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  28.16 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  37.66 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  29.02 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  32.11 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  29.11 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  31.01 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  26.33 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.92 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  27.57 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  29.3 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  31.49 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  34.09 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  29.67 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  30.62 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  27.21 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  28.31 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  27.74 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  24.41 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  29.83 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  25.56 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  32.91 
 
 		 397 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  25.08 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  26.23 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.93 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  30.22 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  21.48 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  27.02 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  27.66 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  26.37 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  32.77 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>