217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0562 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  632  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.76 
 
 		 313 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  36.63 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  37.12 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  34.27 
 
 		 323 aa  153  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  30.42 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.68 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  30.26 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.34 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  34.01 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  35.03 
 
 		 302 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  34.49 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.26 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  34.26 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  32.64 
 
 		 532 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  31.53 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  33.22 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  35.1 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  34.75 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  34.13 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  31.07 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  28.66 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.61 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.16 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  29.62 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  28.71 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  28.28 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  29.51 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.02 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  22.76 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  28.43 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  28.34 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  28.34 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  27.87 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.24 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  32.54 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  29.39 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  21.07 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.3 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  26.92 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  28.21 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.22 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  27.19 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.28 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  26.78 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.13 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  26.14 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  44.93 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  24.6 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  31.32 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  28.85 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  31.32 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  28.85 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  30.54 
 
 		 356 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  30.54 
 
 		 356 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  30.54 
 
 		 356 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  30.54 
 
 		 356 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.3 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  30.54 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  21.58 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  26.92 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.98 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.73 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.76 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  33.86 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  24.9 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.73 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  22.48 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  27.27 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.51 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  25.98 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.93 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  24.65 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  26.11 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  26.73 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  22.09 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  28.33 
 
 		 341 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  28.14 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  21.52 
 
 		 298 aa  50.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 		 292 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  25.9 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 		 298 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  22.71 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>