211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2384 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 305 aa  593  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  96.72 
 
 		 305 aa  557  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  90.43 
 
 		 308 aa  517  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  70.89 
 
 		 299 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  69.18 
 
 		 532 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  56.25 
 
 		 302 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  52.07 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  54.55 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  51.4 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  51.06 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  51.23 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  46.5 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.2 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  47.54 
 
 		 306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.18 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  46.5 
 
 		 304 aa  228  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  48.24 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.73 
 
 		 306 aa  222  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  42.91 
 
 		 281 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.11 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  39.04 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  33.22 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  34.34 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  31.75 
 
 		 313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  31.6 
 
 		 322 aa  89  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  28.3 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  28.3 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  29.31 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  30.42 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  28.81 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  26.01 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  30.6 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  26.01 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.69 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  28.9 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  28.34 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  28.34 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  27.61 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  28.01 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.76 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  26.94 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  22.75 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.4 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  27.48 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1646  hypothetical protein  23.85 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.83 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  29.9 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  26.24 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  26.67 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.05 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.46 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.35 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.83 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  29.63 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  29.69 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  29.69 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  29.69 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  29.69 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  26.42 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  29.21 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  29.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  29.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.41 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  30.7 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.33 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  28.71 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.45 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.9 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  26.34 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  25 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  25.97 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  25.54 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.54 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.85 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  23.17 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  21.89 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.62 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  26.75 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  23.16 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.6 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  23.88 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  23.9 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  30.04 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  31.07 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.57 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  20.62 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.2 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  22.79 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  26.15 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  22.79 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>