164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3210 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  80.47 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  78.42 
 
 		 322 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  81.16 
 
 		 325 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  76.51 
 
 		 316 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  77.78 
 
 		 323 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  70.28 
 
 		 302 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  67.88 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.23 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.53 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  49.49 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  47.24 
 
 		 532 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  47.59 
 
 		 299 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  45.97 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.64 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.75 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  42.76 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  41.99 
 
 		 281 aa  182  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  43.4 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.32 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  40.54 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  33.66 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  35.1 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  31.62 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  28.67 
 
 		 322 aa  86.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  29.7 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.03 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.13 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.16 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  25.56 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  27.78 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.33 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  28.82 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  29.08 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.87 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  25.85 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.19 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.4 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.58 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  27.78 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25.86 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  27.08 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.45 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  28.48 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  26.91 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  26.46 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  26.74 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  26.74 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  25.34 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.953682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.59 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  20.55 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  31.29 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  25.53 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  25.53 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  29.84 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  18.91 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  24.43 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  21.85 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  21.85 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  24.43 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  23.94 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  23.77 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  29.33 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  22.87 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.18 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  26.58 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  26.86 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  26.58 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  21.59 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  25.89 
 
 		 341 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  24.66 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  26.52 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  22.46 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  26.8 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  24.57 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.97 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  20.71 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  20.71 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  20.71 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  32.28 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  20.71 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  23.53 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  28.74 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  32.28 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  32.28 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  32.28 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  32.28 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  28.78 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>