58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1713 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1713  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  616  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165922  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4861  hypothetical protein  40.2 
 
 
300 aa  215  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5181  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  39.53 
 
 
300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5146  hypothetical protein  40.53 
 
 
300 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5175  hypothetical protein  40.53 
 
 
300 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4746  drug/metabolite transporter family membrane protein  40.2 
 
 
300 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5190  hypothetical protein  40.53 
 
 
300 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4902  hypothetical protein  40.53 
 
 
300 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5277  hypothetical protein  40.53 
 
 
300 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4765  drug/metabolite transporter family membrane protein  40.53 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0069  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  39.87 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2668  hypothetical protein  40.46 
 
 
292 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3769  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  37.04 
 
 
302 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.547255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1545  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  37.04 
 
 
304 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0256706  decreased coverage  0.0067742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3349  hypothetical protein  36.03 
 
 
302 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000303507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3369  drug/metabolite exporter family protein  36.36 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00811973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3704  transporter, drug/metabolite exporter family  36.36 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3680  transporter, drug/metabolite exporter family  36.36 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3697  hypothetical protein  36.36 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3418  drug/metabolite exporter family protein  36.03 
 
 
302 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000357503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2318  hypothetical protein  35.69 
 
 
302 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000243844  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1102  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  34.36 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
312 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0369938  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2366  hypothetical protein  30.82 
 
 
298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309949  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
298 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
327 aa  106  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.160476  normal  0.169958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 
299 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 
319 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000893438  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0366  membrane protein  55.88 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.66 
 
 
308 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  27.7 
 
 
317 aa  56.2  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.34 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.57 
 
 
311 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  30.5 
 
 
312 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  23.26 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  24.05 
 
 
302 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  24.05 
 
 
302 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.05 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  23.72 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  23.72 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
289 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  23.83 
 
 
315 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  21.83 
 
 
289 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  22.56 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  31.62 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  26.01 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  21.83 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  28.03 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  23.95 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  30.71 
 
 
320 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.64 
 
 
341 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  26.99 
 
 
278 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  24.05 
 
 
309 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  24.47 
 
 
309 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>