297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1944 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
307 aa  560  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810804  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  40.89 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.39 
 
 
311 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.19 
 
 
311 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.38 
 
 
298 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.62 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  39.42 
 
 
305 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  39.15 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  40.21 
 
 
397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  40.65 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  40.21 
 
 
309 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  40.73 
 
 
309 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  40.73 
 
 
309 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  37.86 
 
 
309 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  40.6 
 
 
312 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  40.93 
 
 
312 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  39.08 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  38.11 
 
 
402 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  29.39 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  28.03 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  26.71 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  37.17 
 
 
356 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  37.17 
 
 
356 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  37.17 
 
 
356 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  37.17 
 
 
356 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  35.19 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.23 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  37.5 
 
 
353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  37.5 
 
 
356 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  37.5 
 
 
356 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
310 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 
295 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  28.06 
 
 
288 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.83 
 
 
333 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.1 
 
 
332 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  30.26 
 
 
316 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  36.74 
 
 
302 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.67 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  27.92 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  37.66 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  31.21 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  30.87 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.79 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  34.26 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  34.26 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  28.52 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  32.7 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  27.89 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  31.91 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.47 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  31.83 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  31.05 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  32.54 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  29.39 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  27.05 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  30.5 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  30.5 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  30.5 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  25.17 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.53 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.78 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  34.67 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  34.46 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  24.83 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.34 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  26.15 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  32.26 
 
 
309 aa  63.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 
341 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  27.42 
 
 
327 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.64 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
325 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  28.69 
 
 
281 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
293 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  25.09 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  27.8 
 
 
281 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  25.09 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  25.55 
 
 
300 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  25.55 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  30.77 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.77 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  28.42 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  31.62 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 
282 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.7 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  30.57 
 
 
304 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  24.72 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.13 
 
 
288 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  25.19 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 
307 aa  55.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  27.68 
 
 
532 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.72 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.11 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  31.29 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  27.92 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  27.82 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>