166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4075 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4075  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  665    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0110  hypothetical protein  92.99 
 
 
326 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0499  hypothetical protein  35.49 
 
 
334 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0111  hypothetical protein  34.86 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  26.17 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.97 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 
291 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  23.69 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  22.45 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  23.08 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  23.17 
 
 
325 aa  59.7  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  22.81 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.58 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  22.86 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 
306 aa  55.8  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  23.13 
 
 
296 aa  55.8  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.17 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  25.86 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  23.63 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.13 
 
 
382 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.02 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.7 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  25.5 
 
 
304 aa  53.9  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  25.52 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  25.17 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0463  hypothetical protein  21.82 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  25.17 
 
 
303 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1447  hypothetical protein  24.75 
 
 
304 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000141757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  25 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  26.12 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  25.52 
 
 
303 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  25.52 
 
 
303 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  25.52 
 
 
303 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  25.17 
 
 
303 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  26.92 
 
 
323 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  22.01 
 
 
312 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  22.01 
 
 
312 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  23.21 
 
 
300 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  22.01 
 
 
312 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  22.01 
 
 
312 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  22.01 
 
 
312 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  21.85 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  22.01 
 
 
312 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  24.04 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  24.76 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.02 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  29.35 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.15 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  23.87 
 
 
305 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  21.85 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  21.69 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  23.31 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  23.58 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  33.59 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  23.89 
 
 
293 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.56 
 
 
311 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.41 
 
 
292 aa  50.4  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  25.36 
 
 
319 aa  49.7  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.81 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  23.26 
 
 
310 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 
297 aa  49.7  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  23.37 
 
 
308 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.24 
 
 
294 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  21.77 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  24.43 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  21.77 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  22.68 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  30 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  30 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  24.59 
 
 
311 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  22.67 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.29 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  23.87 
 
 
305 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  30 
 
 
312 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  21.77 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  23.87 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  21 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  21.77 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  24.24 
 
 
532 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  22.4 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.24 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.28 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  23.81 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  21.77 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.03 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  23.58 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  21.77 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  24.8 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  21.77 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  23.51 
 
 
294 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  23.12 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  22.71 
 
 
305 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  21.77 
 
 
303 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 
305 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>