67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0646 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.85 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  47.24 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  45.58 
 
 		 289 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  46.55 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  46.57 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  45.04 
 
 		 297 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  45.35 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  43.06 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  45.35 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  44.72 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  43.97 
 
 		 314 aa  212  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  39.14 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  45.3 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  42.76 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  42.56 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  39.18 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  45.42 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  45.55 
 
 		 307 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  43.64 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  39.15 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  41.55 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  43.64 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  38.28 
 
 		 289 aa  165  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  43.64 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  44.68 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  41.22 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  34.7 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  38.01 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  41.05 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.8 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  44.44 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  46.27 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  41.42 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  37.01 
 
 		 287 aa  139  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  40.1 
 
 		 194 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  33.58 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  42.54 
 
 		 285 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  32.97 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.65 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.97 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  40 
 
 		 319 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  22.82 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  26.37 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  26.37 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.02 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  26.37 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  20.57 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  23.02 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  23.02 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  23.02 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  23.4 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  25.27 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  20.21 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  22.68 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  20.88 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  32.39 
 
 		 169 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  26.37 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  22.68 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  26.35 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  22.95 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>