91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3318 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  92.98 
 
 		 287 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  53.74 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  58.33 
 
 		 286 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.36 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  56.11 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  55.73 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  54.29 
 
 		 303 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  50.18 
 
 		 285 aa  249  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  52.31 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  51.76 
 
 		 297 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  54.15 
 
 		 285 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  57.19 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  46.69 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  45 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  55.32 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  50.52 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  49.81 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  69.11 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  67.58 
 
 		 285 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  38.94 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  57.76 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  42.52 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  44.22 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  55.67 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  38 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  44.17 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  43.45 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  43.4 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  47.86 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  39.93 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  45.16 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  44.44 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  42.55 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  47.92 
 
 		 194 aa  158  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 307 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  37.89 
 
 		 254 aa  152  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  47.33 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  46.15 
 
 		 282 aa  148  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.39 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  48.28 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  30.49 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  30.29 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  29.81 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  29.81 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  29.81 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  31.11 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  33.08 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  31.25 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.9 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.41 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  31.02 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  23.44 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0670  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.407071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  29.24 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  29.24 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  29.24 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  29.24 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  29.24 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  28.27 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  29.24 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 314 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  30.73 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  28.88 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  26.89 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  26.89 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  26.89 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  29.48 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  28.62 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  26.89 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  26.89 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4101  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.28 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  24.07 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  29.03 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4446  hypothetical protein  32.81 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  27.55 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  25.49 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  31.28 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.65 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.82 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>