19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0157 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0157  hypothetical protein  100 
 
 
751 aa  1494    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3725  hypothetical protein  50.66 
 
 
728 aa  650    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0269  hypothetical protein  37.36 
 
 
583 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2930  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.72 
 
 
316 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  30.91 
 
 
316 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  31.03 
 
 
315 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  22.42 
 
 
2449 aa  63.5  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.43 
 
 
305 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3422  hypothetical protein  26.97 
 
 
1374 aa  53.5  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  29.53 
 
 
325 aa  52  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2677  hypothetical protein  26.42 
 
 
710 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  29.73 
 
 
331 aa  48.9  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  29.73 
 
 
331 aa  48.9  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  30.77 
 
 
310 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.89 
 
 
310 aa  46.6  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  24.49 
 
 
319 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 
301 aa  45.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  25.17 
 
 
319 aa  44.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  26.09 
 
 
303 aa  44.3  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>