205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2640 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  89.26 
 
 		 299 aa  487  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  71.04 
 
 		 298 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  69.97 
 
 		 307 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  68.97 
 
 		 298 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  69.97 
 
 		 307 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  71.04 
 
 		 298 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  70.23 
 
 		 308 aa  348  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  59.73 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.02 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.02 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  61.13 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.37 
 
 		 300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.02 
 
 		 300 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  55.48 
 
 		 301 aa  298  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  55.1 
 
 		 300 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  55.1 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  54.76 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  54.39 
 
 		 299 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  56.75 
 
 		 306 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  54.42 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  52.58 
 
 		 318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  55.99 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  55.63 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  55.63 
 
 		 512 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.56 
 
 		 299 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  52.72 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  59.5 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  56.21 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  53.06 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.9 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  53.7 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  39.07 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  42.23 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.93 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  38.78 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  42.91 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  29.9 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  29.17 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.5 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  29.71 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  29.71 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.5 
 
 		 312 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  29.71 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.35 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  30.29 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  41.33 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  30.15 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  28.93 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.34 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  32.21 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  30.04 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  27.84 
 
 		 281 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.26 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  28.47 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  28.7 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  29.35 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  30.5 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  30.5 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.46 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  25.63 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  25.08 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  26 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.73 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  26.39 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  28.65 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  28.5 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  25.37 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  25.65 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  27.23 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.73 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  26.87 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  26.69 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1166  hypothetical protein  28.91 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.533406  normal  0.0102803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  24.64 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  25.28 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  28.12 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  24.64 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  22.86 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  26.46 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  26.46 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  26.46 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  33.58 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.99 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.22 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  27.01 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.2 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  28.93 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.97 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  26.85 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  24.18 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  30.2 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  24.64 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>