227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2488 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  65.19 
 
 		 318 aa  361  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  56.85 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.26 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.26 
 
 		 300 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  55.71 
 
 		 307 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  55.71 
 
 		 307 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  55.29 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  60.36 
 
 		 299 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  53.04 
 
 		 302 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  56.33 
 
 		 304 aa  292  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  53.47 
 
 		 299 aa  289  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  55.56 
 
 		 512 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  55.75 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  55.75 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  51.92 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  51.57 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  51.22 
 
 		 300 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  54.36 
 
 		 306 aa  278  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  59.86 
 
 		 308 aa  278  8e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  62.88 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  50.69 
 
 		 301 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.75 
 
 		 300 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.09 
 
 		 300 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  55.94 
 
 		 298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  56.01 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.96 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  51.22 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  58.61 
 
 		 255 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  51.57 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  52.54 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.57 
 
 		 329 aa  245  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  41.03 
 
 		 312 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  41.55 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.18 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  39.93 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  38.91 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  30.74 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.79 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  30.27 
 
 		 307 aa  135  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  31.32 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  31.32 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  28.33 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  28.33 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  34.07 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.23 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  27.55 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  27.99 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  27.99 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  28.32 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  40.07 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  32.11 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  28.07 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.37 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  27.48 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  28.97 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  27.34 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  29.24 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  26.32 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  26.24 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.81 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  26.5 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  26.06 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.81 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.69 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  25.5 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  25.47 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  26.02 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  24.82 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  25.5 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  25.25 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  23.88 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  27.8 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  24.16 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  29.22 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  31.5 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.1 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  26.3 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  27.36 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2851  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17163 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.6 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  28.06 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  24.64 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  24.79 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  23.73 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  22.58 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>