More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0742 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  596  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4399  hypothetical protein  81.25 
 
 		 308 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  30 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  31.11 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.89 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  29.34 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.55 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  28.62 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  30.38 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.95 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.52 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  29.2 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.7 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  28.31 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  24.26 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  24.63 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  26.95 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  26.53 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  26.4 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  26.8 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.03 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.8 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  26 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  26 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  28.37 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  27.09 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  22.68 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  24.75 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  28.15 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  32.18 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.18 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  25.6 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  27.19 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.83 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  26.61 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  22.06 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.75 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  26.64 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  22.06 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  26.23 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  27.27 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.22 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  23.95 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.13 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25.08 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  28.69 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  24.3 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  26.09 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  26.09 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  26.27 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  26.09 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  26.27 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.48 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  24.77 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  26.23 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.88 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  25.32 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  24.31 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  26.52 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  27.23 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  25.81 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  24.31 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  25 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  30.04 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.27 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.5 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.2 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  23.86 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  24.31 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  24.31 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  24.31 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  24.31 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  25.69 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  26.81 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  27.16 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  25.42 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>