263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4483 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.4 
 
 		 299 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.87 
 
 		 299 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  44.64 
 
 		 296 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  41.11 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  45.91 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  43.06 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.24 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  40.62 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.5 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  43.66 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  37.68 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  41.58 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.62 
 
 		 293 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.21 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  39.66 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  43.21 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  38.38 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.59 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  38.75 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  37.25 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.52 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  39.66 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  38.01 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.4 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  40.15 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  41.84 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  44.68 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  39.16 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  36.43 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  40.91 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  40.48 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  38.49 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  37.93 
 
 		 325 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  39.93 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  44.13 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  39.86 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.95 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  38.49 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  38.28 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  38.28 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  39.86 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  42.61 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  35.89 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  40.3 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  38.28 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  38.01 
 
 		 291 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  35.56 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  32.28 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  35.82 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  35.66 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  37.97 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  34.49 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  38.79 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  38.79 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  38.79 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  38.79 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  38.79 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  38.79 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  38.79 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  36.71 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  38.85 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  31.72 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.27 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  36.84 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  27.96 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  31.51 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  32.43 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  30.8 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  30.27 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.97 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.83 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  28.82 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  30.6 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  28.91 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  28.37 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  26.44 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  27.76 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  29.55 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  29.14 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  27.17 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  29.72 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  28.86 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  28.86 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  27.85 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.22 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  29.72 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  28.86 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  26.03 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  29.37 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  27.9 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  28.11 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>