160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1416 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  552  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  73.52 
 
 		 293 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  73.52 
 
 		 293 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  74.22 
 
 		 293 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  70.38 
 
 		 287 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  74.22 
 
 		 293 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  72.44 
 
 		 287 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  52.57 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  54.61 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  53.68 
 
 		 293 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  52.61 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  52.26 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  52.26 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  51.06 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  51.05 
 
 		 287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  51.06 
 
 		 287 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2931  hypothetical protein  51.06 
 
 		 287 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  51.06 
 
 		 312 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3416  hypothetical protein  51.06 
 
 		 287 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3072  hypothetical protein  51.77 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  51.06 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2986  hypothetical protein  52.84 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0531098 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  51.06 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.48 
 
 		 287 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3123  hypothetical protein  52.28 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.47 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3244  hypothetical protein  49.29 
 
 		 288 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.45 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  35.79 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.94 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  31.99 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  33.45 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  32.61 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  34.67 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  35.11 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  31.47 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  32.97 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  29.02 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  32.51 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  32.61 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  30.53 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  31.8 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  34.28 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  32.61 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  32.62 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  32.99 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  29.31 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  29.86 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  35.51 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  34.59 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.16 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  32.38 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  30.96 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  31.85 
 
 		 296 aa  92  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  30.54 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  35.77 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  32.53 
 
 		 308 aa  89  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  33.1 
 
 		 325 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.3 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  26.44 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  28.72 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  30.14 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  29.86 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  31.16 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  32.64 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  32.64 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  27.74 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  33.18 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  27.72 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  29.62 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  30.82 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  28.93 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  28.18 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  27.64 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  26.26 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  25.95 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  30.97 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  28.98 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.68 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1803  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  29.1 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  25.99 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0332  hypothetical protein  25.6 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0350  hypothetical protein  25.6 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  28.42 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  29.37 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  29.37 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>