114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5922 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  56.61 
 
 		 299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  57.89 
 
 		 295 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  57.54 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  57.89 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  56.54 
 
 		 293 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.06 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  54.61 
 
 		 287 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  57.25 
 
 		 287 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.06 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  58.7 
 
 		 312 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2986  hypothetical protein  57.8 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0531098 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  58.33 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  58.33 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2931  hypothetical protein  58.33 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  58.33 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3416  hypothetical protein  58.33 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3072  hypothetical protein  57.61 
 
 		 293 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  58.33 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3244  hypothetical protein  59.93 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3123  hypothetical protein  56.03 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  53.93 
 
 		 287 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  53.93 
 
 		 287 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  51.25 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  53.33 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  53.33 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  53.31 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  33.71 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.86 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  35.27 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  33.99 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  36.27 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.84 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  27.76 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.51 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  34.15 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  35.42 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  31.56 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  28.72 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  32.16 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  34.53 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  33.1 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  32.99 
 
 		 291 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  34.04 
 
 		 297 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  32.53 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  28.77 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  31.16 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  31.29 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  32.18 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  35.21 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  28.98 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  31.82 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  28.24 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.46 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  30.26 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  27.87 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  29.05 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  26.43 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  29.11 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  28.42 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  27.5 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  28.77 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  27.82 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  25.98 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  28.42 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  28.42 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  29.82 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  32.25 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  30.58 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  27.11 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  27.66 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  26.8 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  27.72 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  24.81 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  22.18 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  30.36 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  31.06 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  26.69 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  26.99 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.51 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  23.78 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.38 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>