289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4510 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 296 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  88.81 
 
 		 296 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.46 
 
 		 307 aa  292  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  64.46 
 
 		 307 aa  291  8e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  60.81 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.17 
 
 		 296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  48.43 
 
 		 305 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  50.34 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.4 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.27 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  45.76 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  45.07 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  44.97 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.1 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  47.69 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.76 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  45.61 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  47.54 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  45.77 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.62 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  45.26 
 
 		 283 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  44.17 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  45.45 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  45.45 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  46.24 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  47.84 
 
 		 309 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  47.52 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  38.27 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.55 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  40.28 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  47.84 
 
 		 292 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.88 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  44.6 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  47.13 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.84 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  44.55 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  45.36 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  41.03 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  42.01 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.54 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  41.16 
 
 		 291 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  36.7 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  37.23 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  41.44 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  46.4 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  41.49 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  44.48 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  44.48 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  44.48 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  44.48 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  44.48 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  44.48 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  44.48 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  41.81 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  44.12 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  43.8 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  38.63 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  39.86 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  39.72 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  34.63 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  39.36 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  44.24 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  34.04 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  32.48 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  42.96 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.96 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  31.41 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  35.69 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  34.49 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.27 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.27 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.46 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.62 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  38.28 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  32.87 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.1 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  30.94 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  29.07 
 
 		 287 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  31.94 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  31.54 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  30.11 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  33.79 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  32.37 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  36.45 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  33.67 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  27.84 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  33.67 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  33.67 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  36.54 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  37.2 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3416  hypothetical protein  37.2 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  37.2 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  28.95 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2931  hypothetical protein  37.2 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  37.2 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  28.72 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.21 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  32.2 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>