165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3300 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 287 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  91.99 
 
 		 287 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  61.75 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  56.1 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  56.99 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  55.75 
 
 		 295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  55.75 
 
 		 295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  61.4 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  54.7 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  61.4 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2931  hypothetical protein  61.4 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  61.05 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3416  hypothetical protein  61.4 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  61.4 
 
 		 312 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  56.06 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  61.4 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3072  hypothetical protein  58.39 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2986  hypothetical protein  57.19 
 
 		 293 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0531098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3123  hypothetical protein  54.04 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3244  hypothetical protein  56.14 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  48.24 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  49.47 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  47.7 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  47.7 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  47.9 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  45.39 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  45.04 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.84 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.87 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  33.45 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  31.01 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  34.25 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  37.5 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  36.43 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  30.8 
 
 		 295 aa  98.6  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  34.91 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  32.98 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  34.08 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  33.56 
 
 		 300 aa  92  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  36.21 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  31.72 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  36.46 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  33.33 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.83 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  32.29 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  27.54 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.95 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  30.3 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  30.16 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  29.37 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  35.49 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  31.19 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  32.18 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  28.93 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.49 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  33.45 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  35.69 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  28.87 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  31.1 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 		 367 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  29.7 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  26.77 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  29.24 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  28.62 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  30.71 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  29.68 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  29.12 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  29.07 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  27.14 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  31.34 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  27.82 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  30.71 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  30.63 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.47 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  30.28 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  27.17 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.73 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  29.96 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  29.39 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3540  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  31.34 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  25.53 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.04 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  26.39 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.02 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  25.99 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  26.07 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1803  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.21 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  31.72 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>