147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4718 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  100 
 
 		 302 aa  574  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  71.99 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.45 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  54.58 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  50.18 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  49.12 
 
 		 325 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  50.18 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  49.48 
 
 		 289 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  49.48 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  49.3 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  51.24 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  51.24 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  51.24 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  51.24 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  51.24 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  51.24 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  51.24 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  48.07 
 
 		 291 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  50.36 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  43.06 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  48.55 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  43.01 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  46.89 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  37.06 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.54 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  41.04 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  36.64 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  36.84 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  38.1 
 
 		 296 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.38 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  39.93 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.43 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  35.27 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.28 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.8 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  33.92 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  37.41 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.85 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.73 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  36.08 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  32.51 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  39.73 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.43 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.57 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  33.46 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  37.54 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  36.46 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  36.73 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  33.68 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  35.55 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  31.16 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  36.88 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  27.15 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  31.62 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  33 
 
 		 307 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  33.92 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  32.29 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  31.38 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  34.74 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  35.71 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  30.74 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.8 
 
 		 291 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  26.99 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  28.87 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  30.94 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  32 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  31.67 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  31.67 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  31.33 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  30.6 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.2 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  27.72 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  31.72 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  29.09 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28.91 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.5 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  27.3 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  30.69 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.65 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  30.69 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  30.6 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  31.75 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  30.48 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  31.75 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  31.75 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  30.77 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  26.14 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2931  hypothetical protein  31.75 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  31.75 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3416  hypothetical protein  31.75 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3072  hypothetical protein  32.28 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  29.17 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>