More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2902 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  568  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  54.61 
 
 
292 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  54.74 
 
 
289 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  53.58 
 
 
292 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.89 
 
 
293 aa  235  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  52.96 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  48.4 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  50 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  50.53 
 
 
283 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  46.57 
 
 
285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  51.25 
 
 
291 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.64 
 
 
291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  51.08 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.57 
 
 
305 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  42.5 
 
 
305 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  49.12 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  48.01 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.88 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  41.87 
 
 
299 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  42.35 
 
 
295 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  51.44 
 
 
296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.66 
 
 
296 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  44.91 
 
 
296 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  42.2 
 
 
295 aa  189  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.35 
 
 
294 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.22 
 
 
295 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  40.48 
 
 
305 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  42.66 
 
 
300 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  42.86 
 
 
293 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.78 
 
 
299 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.61 
 
 
307 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  40.61 
 
 
307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.77 
 
 
299 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  41.87 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  43.77 
 
 
317 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  41.57 
 
 
298 aa  159  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.55 
 
 
299 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  38.87 
 
 
289 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  38.49 
 
 
325 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  39.36 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  36.71 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.55 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  34.88 
 
 
307 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  37.91 
 
 
281 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  41.49 
 
 
302 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  36.4 
 
 
297 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.09 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  36.39 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  35.44 
 
 
306 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  38.11 
 
 
289 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  39.08 
 
 
291 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  37.76 
 
 
289 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  37.5 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  35 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  38.71 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  39.43 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  39.43 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  39.43 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  39.43 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  39.57 
 
 
301 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  39.57 
 
 
301 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  33.69 
 
 
299 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  32.98 
 
 
305 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  37.87 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  39.57 
 
 
301 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  33.1 
 
 
289 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.56 
 
 
313 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  39.86 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  30.53 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  35.12 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  32.5 
 
 
298 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  35.05 
 
 
293 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  35.94 
 
 
293 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  34.4 
 
 
287 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  35.94 
 
 
293 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  34.15 
 
 
307 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 
287 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  32.95 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  35.23 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  34.03 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  34.23 
 
 
307 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  34.23 
 
 
307 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  34.36 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  34.28 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  33.08 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  34.27 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  34.27 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  34.27 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  33.57 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.07 
 
 
287 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2986  hypothetical protein  32.65 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0531098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  31.87 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  30.39 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  30.42 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  31.29 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3123  hypothetical protein  33.22 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>