174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4880 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  71.99 
 
 		 302 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.42 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  52.69 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  52.69 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  53 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  50.9 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  51.61 
 
 		 289 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  51.61 
 
 		 289 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  50.18 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  46.98 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  51.43 
 
 		 301 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  51.43 
 
 		 301 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  51.43 
 
 		 301 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  51.43 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  51.43 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  51.43 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  51.43 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  51.26 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  44.09 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  50.54 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  42.16 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  37.8 
 
 		 289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  45.36 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.23 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  42.26 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  39.26 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  37.5 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.95 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  38.25 
 
 		 289 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  36.71 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  36.71 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.99 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.68 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  38.68 
 
 		 307 aa  133  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  37.19 
 
 		 283 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.74 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  40.22 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  35.82 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.1 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.32 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.54 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  39.57 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.39 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  31.25 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  35.62 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  36.52 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  34.51 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  35.99 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  37.05 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  38.57 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  28.47 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  37.29 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  30.69 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  32.89 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  35.44 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  31.65 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  31.34 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  27.61 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  32.73 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  37.5 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  32.37 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  30.72 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  32.88 
 
 		 297 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  33.91 
 
 		 297 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  30.66 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.57 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  32 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  31.53 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  28.62 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  29.37 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  29.51 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28.28 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  31.4 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  30.51 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  31.4 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.41 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  29.64 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  28.92 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  29.79 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  28.93 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  29.43 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  29.43 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  27.4 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  29.43 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  30.04 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  32.55 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  30.04 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.52 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  30.39 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  30.31 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.84 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  29.8 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>