204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2005 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  99.67 
 
 
301 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  99.34 
 
 
301 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  99.67 
 
 
301 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  99.67 
 
 
301 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  99.34 
 
 
301 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  99.67 
 
 
301 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  75.96 
 
 
289 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  91.03 
 
 
301 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  75.34 
 
 
325 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  75.61 
 
 
289 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  75.61 
 
 
289 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  75.96 
 
 
289 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.02 
 
 
290 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  72.28 
 
 
309 aa  359  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  73.7 
 
 
291 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  67.14 
 
 
293 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  74.48 
 
 
323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  49.65 
 
 
286 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  52.1 
 
 
302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  53.21 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  46.31 
 
 
305 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  45.52 
 
 
296 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  39.07 
 
 
289 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.9 
 
 
296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  44.17 
 
 
296 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.6 
 
 
299 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  46.18 
 
 
302 aa  175  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.64 
 
 
307 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  44.64 
 
 
307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  39.1 
 
 
305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.39 
 
 
299 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  39.93 
 
 
283 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  39.79 
 
 
285 aa  158  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  39.29 
 
 
289 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  37.54 
 
 
295 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.45 
 
 
305 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.32 
 
 
296 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.14 
 
 
293 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.75 
 
 
305 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.2 
 
 
295 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  42.7 
 
 
292 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.03 
 
 
294 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  37.88 
 
 
307 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  38.77 
 
 
298 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  40.97 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  39.01 
 
 
296 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  36.08 
 
 
300 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  39.47 
 
 
298 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  34.98 
 
 
295 aa  136  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  31 
 
 
305 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  39.78 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  38.11 
 
 
289 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  39 
 
 
317 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  35.66 
 
 
281 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  31.32 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  37.15 
 
 
291 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  36.71 
 
 
297 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.9 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  36.52 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  37.59 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  32.64 
 
 
306 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  36.05 
 
 
306 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  34.95 
 
 
291 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  31.12 
 
 
307 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  34.15 
 
 
297 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  31.21 
 
 
319 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  33.9 
 
 
315 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.94 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 
313 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.13 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  30.64 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  27.59 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.84 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  32.41 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  28.37 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  31.27 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  30.36 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  27.72 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  31.53 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  27.2 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  27.2 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  32.3 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  29.05 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  27.2 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.03 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  33.69 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  27.59 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  29.02 
 
 
312 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  31.06 
 
 
295 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  31.06 
 
 
295 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  31.06 
 
 
295 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  33.68 
 
 
287 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  33.68 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  27.27 
 
 
364 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>