205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4954 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 305 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  46.21 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1398  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.32 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.509319  decreased coverage  0.000513734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  37.86 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  36.33 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.55 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  36.71 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.96 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  31.42 
 
 		 289 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  33.46 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.72 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  34.42 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.21 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  37.5 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3679  membrane protein  33.58 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  34.4 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.84 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  32.6 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.86 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.17 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  28.76 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.07 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  35.23 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  38.6 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  32.35 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  32.31 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  34.72 
 
 		 307 aa  99  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  34.11 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  34.11 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  33.97 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  33.1 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.89 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  35.53 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  35.23 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.62 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.97 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.33 
 
 		 313 aa  92.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  35.31 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47870  hypothetical protein  39.06 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000948386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  28.35 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  33.45 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  28.42 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03770  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  37.45 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.248396 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  32.37 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  34.26 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  34.66 
 
 		 289 aa  89.4  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  28.48 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  32.98 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  33.45 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  34.16 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4125  hypothetical protein  38.67 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00418319  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  34.16 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  31.27 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  34.04 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  32.98 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  33.21 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  32.33 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  34.56 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  32.14 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  32.53 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  32.65 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  32.45 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  26.92 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  33.56 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  26.74 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  30.82 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  34.45 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  33.62 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  30.71 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.02 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  35.16 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  32.75 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  34.42 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  34.42 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  31.23 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  31.88 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  34.42 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  34.42 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  34.42 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  34.42 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  34.21 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  31.06 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  30.95 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  30.74 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  30.74 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  34.42 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  32.95 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  29.35 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  28.57 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  31.53 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.29 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.52 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  34.66 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  31.35 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>