171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3991 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  547  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  97.91 
 
 
287 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  72.44 
 
 
287 aa  364  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  66.32 
 
 
293 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  64.91 
 
 
293 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  65.96 
 
 
293 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  65.96 
 
 
293 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  55.87 
 
 
293 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  55.48 
 
 
295 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  55.12 
 
 
295 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  55.12 
 
 
295 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  50.88 
 
 
299 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  53.93 
 
 
298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  52.46 
 
 
287 aa  228  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2986  hypothetical protein  55 
 
 
293 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0531098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3072  hypothetical protein  54.29 
 
 
293 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  51.59 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  51.59 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2931  hypothetical protein  51.59 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  51.59 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3416  hypothetical protein  51.59 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  51.59 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  51.59 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3123  hypothetical protein  54.64 
 
 
293 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.57 
 
 
287 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3244  hypothetical protein  50.87 
 
 
288 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.87 
 
 
287 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.7 
 
 
305 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.14 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.61 
 
 
305 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  36.71 
 
 
307 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  36.68 
 
 
289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  36.82 
 
 
296 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  33.1 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  34.17 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  29.86 
 
 
305 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  35.29 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  33.22 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  31.43 
 
 
295 aa  108  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  36.14 
 
 
289 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.82 
 
 
293 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  32.3 
 
 
300 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
295 aa  106  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  34.98 
 
 
297 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  34.16 
 
 
297 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  30.18 
 
 
291 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  31.21 
 
 
299 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.81 
 
 
299 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  34.27 
 
 
306 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  37.18 
 
 
292 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  31.52 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  29.72 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  34.74 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 
313 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  33.1 
 
 
308 aa  95.9  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  34.48 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  34.06 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  32.36 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  35.9 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  29.9 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  30.5 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  32.84 
 
 
296 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  28.82 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  30.1 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  31.82 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.3 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  31.23 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  31.82 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  31.58 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  31.58 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.29 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  31.29 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.69 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  29.14 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  31.56 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  30.66 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  27.94 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  29.55 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  30.83 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 
367 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  27.44 
 
 
319 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.34 
 
 
290 aa  55.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  25.35 
 
 
319 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  28.42 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  27.3 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  28.86 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  28.86 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  28.86 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  28.86 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  28.86 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  28.86 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  24.28 
 
 
306 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3540  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 
313 aa  53.1  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  26.55 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>