More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5011 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  99.35 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  93.56 
 
 		 307 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  95.59 
 
 		 307 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  91.53 
 
 		 307 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  37.32 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  35.4 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.63 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  30.88 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  31.49 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  35.12 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.2 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.31 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3679  membrane protein  36.3 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.31 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1398  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.24 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.509319  decreased coverage  0.000513734 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  29.02 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  33.44 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  30.61 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47870  hypothetical protein  34.94 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000948386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  30.6 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4125  hypothetical protein  34.57 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00418319  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  28.47 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  30.24 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.36 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  31.67 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  29.37 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  27.6 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  33.79 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  34.07 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.86 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  31.86 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  35.14 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  30.1 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  31.32 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  32.57 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  27.82 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  31.97 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  33.68 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  27.46 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  31.53 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  27.06 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  28.71 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  29.72 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  31.87 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  26.22 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  30.67 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  30.42 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.39 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  27.97 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.55 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  28.94 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  27.82 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  29.05 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  31.17 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  29.82 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  28.33 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.74 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  27.53 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  28.18 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  28.18 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  29.55 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  29.58 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  27.05 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  30.1 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  28.62 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  28.37 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  28.26 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03770  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  32.13 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.248396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  26.3 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  28.27 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  29.86 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  26.6 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  26.6 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  26.6 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  26.95 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  26.6 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  26.6 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.08 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  29.45 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  23.94 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  25.89 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  27.66 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.44 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.46 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  27.2 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  24.42 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>