145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0052 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 313 aa  578  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  43.31 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1398  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.5 
 
 		 368 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.509319  decreased coverage  0.000513734 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03770  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  48.92 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.248396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  38.68 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  35.36 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  38.32 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.13 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  35.15 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  34.7 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  34.81 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  34.47 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  34.47 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  34.47 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4125  hypothetical protein  40.84 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00418319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  39.29 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47870  hypothetical protein  40.84 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000948386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3679  membrane protein  35.93 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  37.14 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.04 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.84 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.4 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  34.03 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  31.96 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  33.45 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  30.74 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  37.14 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  35.74 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.18 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  28.62 
 
 		 295 aa  90.9  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  37.5 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  32.16 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  31.47 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.14 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.89 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  31.47 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  33.89 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  32.35 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  34.31 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  32.19 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  27.86 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  32.06 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.91 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.58 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  33.57 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  34.41 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  25 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  32.08 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  25.42 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  31.21 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  31.82 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  27.95 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  36.09 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  31.47 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  32.88 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  34.1 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  30.85 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  27.76 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  31.12 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  30.42 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  33.66 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  26.06 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  33 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  32.23 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  26.57 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  29.79 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  33.19 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.79 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  30.07 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  28.78 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  31.58 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  27.3 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  28.78 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  28.78 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  25.26 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  28.26 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  34.66 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  34.66 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  34.66 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  34.66 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  34.66 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  34.66 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  31.37 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.01 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  30.03 
 
 		 308 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  31.69 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  35.02 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  31.46 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.62 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  27.38 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  22.22 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>