256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3069 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  567  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  77.47 
 
 
306 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.32 
 
 
294 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  65.62 
 
 
300 aa  319  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  65.22 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  61.3 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  50.84 
 
 
307 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.01 
 
 
305 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.51 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  47.37 
 
 
289 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  45.83 
 
 
295 aa  235  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.02 
 
 
295 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  48.08 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  46.29 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.21 
 
 
293 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  48.07 
 
 
292 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  39.66 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  47.06 
 
 
289 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  47.72 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  39.18 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  41.16 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  43.34 
 
 
308 aa  178  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  45.76 
 
 
296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.41 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  37.01 
 
 
285 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.24 
 
 
299 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  44.98 
 
 
298 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.75 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  43.06 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  35.62 
 
 
307 aa  162  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  43.4 
 
 
291 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  37.59 
 
 
299 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  40 
 
 
296 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.48 
 
 
296 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  42.71 
 
 
291 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  37.5 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  34.15 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  37.5 
 
 
297 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  35.86 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  34 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  38.97 
 
 
286 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.84 
 
 
290 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.51 
 
 
307 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  39.51 
 
 
307 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.85 
 
 
296 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  35.56 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  35.17 
 
 
325 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  35.52 
 
 
289 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  35.86 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  35.86 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  37.24 
 
 
305 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.2 
 
 
299 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  35.92 
 
 
289 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  34.97 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  34.39 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  33.94 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  35.21 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  34.92 
 
 
304 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.79 
 
 
287 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  32.99 
 
 
287 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  33.8 
 
 
293 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  35.55 
 
 
302 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  34.14 
 
 
301 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  34.14 
 
 
301 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  34.14 
 
 
301 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  34.14 
 
 
301 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  34.14 
 
 
301 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  34.14 
 
 
301 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  33.07 
 
 
323 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  31.23 
 
 
315 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  34.14 
 
 
301 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  33.8 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  29.79 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  30.34 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  31.01 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  31.47 
 
 
298 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  30.1 
 
 
310 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.47 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 
287 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  31.8 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 
306 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  32.63 
 
 
287 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  31.93 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  29.19 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  30.56 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  31.56 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  31.56 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  33.46 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  30.04 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  31.89 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  32.69 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  33.08 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  29.49 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>