199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1987 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  91.03 
 
 		 290 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  79.29 
 
 		 293 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  69.55 
 
 		 289 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  69.9 
 
 		 289 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  68.51 
 
 		 325 aa  358  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  68.86 
 
 		 289 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  68.51 
 
 		 289 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  68.04 
 
 		 291 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  69.46 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  71.28 
 
 		 301 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  71.28 
 
 		 301 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  71.28 
 
 		 301 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  71.28 
 
 		 301 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  71.28 
 
 		 301 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  71.28 
 
 		 301 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  71.28 
 
 		 301 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  70.5 
 
 		 301 aa  292  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  50.35 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  54.58 
 
 		 302 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  53 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  47.97 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  39.86 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.78 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  45.19 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.67 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  39.93 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  38.49 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  37.15 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.64 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  43.91 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  39.12 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.56 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.88 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.41 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  42.41 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  36.86 
 
 		 289 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.55 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  41.61 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  36.64 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  39.93 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.68 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  39.1 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  35.79 
 
 		 296 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  34.64 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.18 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.84 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  34.47 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  31.58 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  31.16 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  36.68 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  35.94 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  38.57 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  34.98 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  39.26 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  29.9 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  31.69 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  35.82 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  35.64 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  35.92 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  29.22 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  34.27 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.4 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  34.39 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  34.52 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  34.75 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  29.11 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  29.43 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  35.76 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  28.87 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.1 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  26.32 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.33 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  27.31 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  29.51 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  29.12 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  28.37 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  30.95 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  28.04 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  28.04 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  32.21 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  28.04 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  31.03 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  27.82 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  30.1 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  30.05 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.25 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  28.34 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  25.65 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  25.65 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  30.16 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>