241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3346 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  78.26 
 
 		 308 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77 
 
 		 297 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  38.43 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3679  membrane protein  37.64 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47870  hypothetical protein  41.18 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000948386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4125  hypothetical protein  41.41 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00418319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  36.1 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.17 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  31.93 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1398  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.7 
 
 		 368 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.509319  decreased coverage  0.000513734 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  32.63 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  31.79 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  31.79 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  31.79 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  32.51 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  30.93 
 
 		 296 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  31.31 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.97 
 
 		 305 aa  89.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  38.14 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  31.61 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  29.75 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  28.57 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  28.76 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  36.02 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  32.37 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  31.54 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  31.14 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  26.91 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  32.26 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  31.39 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  27.72 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  29.82 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  25.93 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  28.73 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  28 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  27.76 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03770  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  31.63 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.248396 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  25.53 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  28.08 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  28 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  24.2 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  31.82 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  25.95 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  28.95 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  27.54 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  26.98 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  31.37 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  28.47 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  27.6 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  26.57 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  25.9 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  28.47 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  25.27 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  26.83 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  31.98 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  26.06 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  27.66 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  26.32 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  29.69 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  24.16 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.11 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  28.27 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  27.8 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  28.32 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  25.55 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  25.55 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  24.16 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  27.4 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  24.16 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  25.55 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  25.11 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  26.9 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  31.72 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  26.43 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  25.55 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  24.44 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  25.55 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  24.44 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  26.02 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  25.55 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  24.91 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  26.16 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>