More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0878 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 306 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  72.58 
 
 		 312 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  72.26 
 
 		 312 aa  401  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  70.28 
 
 		 304 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  47.77 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  33.45 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  35.56 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  34.03 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  32.85 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  33.09 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  33.09 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.52 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  31.62 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  31.32 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  31.9 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 348 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  30.14 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  31.83 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  32.62 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  28.37 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  32.82 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  32.13 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  29.62 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  30.88 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1803  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.32 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  28.98 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  32.39 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  29.51 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  31.29 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  30.93 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  27.18 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.01 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.14 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  30.08 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  33.21 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  27.55 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.71 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  26.07 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  32.63 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.2 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  30.27 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  30.72 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  32.27 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  26.32 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  28.93 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  30.97 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  28.57 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0869  hypothetical protein  27.14 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  27.97 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  30.04 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  26.19 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  25.44 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  27.05 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.52 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  28.07 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  31.56 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  26.17 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  29.23 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  25.78 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  29.35 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  28.07 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  27.45 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  28.32 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  29.25 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.39 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  28.67 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  28.32 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.74 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  24.57 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  23.53 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  28.67 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  27.97 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  28.02 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3540  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.26 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>